GenSurv+: Genomic Pathogen Surveillance and Translational Research plus

Die genomische Charakterisierung von Krankheitserregern spielt eine wichtige Rolle für das Pandemie-Management, die Infektionsprävention und -kontrolle sowie für die individuelle Patient*innenversorgung. GenSurv+ erweitert das bestehende GenSurv-Projekt um multiresistente Erreger am Beispiel von Carbapenemase-produzierende Enterobacterales (CPE). Die genomische Surveillance ermöglicht Erkenntnisse über die Biologie, Evolution und Übertragung von Infektionserregern und verbessert die Wahrnehmung von Übertragungen, Übertragungsketten, Clustern und Ausbrüchen; sie trägt zur Prävention von nosokomialen, also im Kontext medizinischer Behandlungen erworbenen Infektionen bei. Multiresistente Erreger sind aufgrund der begrenzten Behandlungsmöglichkeiten für infizierte Patient*innen von großer klinischer Bedeutung, wobei CPE die am meisten gefürchteten sind. Da zwischen Ansteckung und Erkrankung bei CPE ein längerer Zeitraum vergehen kann, bezeichnet man die weltweite Ausbreitung dieser Erreger auch als „stille Pandemie“.
GenSurv⁺ steht vor der Herausforderung, die Ausbreitung der „stillen Pandemie“ multiresistenter Erreger mithilfe von genomischer Surveillance einzudämmen. Die Integration und Analyse von Sequenzierungs-Daten erfordert die Koordination zwischen NUM-Standorten, dem öffentlichen Gesundheitsdienst und Laboren sowie eine starke Datenschutzkonformität und Zusammenführung mit bestehenden Infrastrukturen. Besonders die Einbindung lokaler Gesundheitsbehörden erfordert klare Empfehlungen, technologische Schnittstellen und Leitlinien für die effektive Nutzung von genetischen Daten. Hinzu kommt, dass die Sequenzierung von Bakteriengenomen aufgrund der höheren Komplexität gegenüber Viren erschwert ist.